末代御医分集剧情介绍(1-20集)大结局
末代御医第1集剧情介绍
杜仲追查 光绪死因
播出日期: 2016.03.28 (一)
杜仲赶往瀛台，为已奄奄一息的光绪皇帝把脉并好言安慰光绪。御医张正元反对杜仲开的药药性太猛，不适宜虚弱的光绪服用。他不理众人反对，自己煎药，当他折返光绪寝宫，已见隆裕、瑾妃、载沣跪在床前痛哭，晴天霹雳光绪已驾崩。杜仲怀疑光绪死于砒霜毒，慈喜允许杜仲一天时间查出光绪死因。杜仲回到寝宫，已被清洁得乾净，却在椅脚下发现一个相识的玉珮。
伏苓宁死不嫁杜仲
追溯十年前，拿着玉珮的伏苓从外地回到家乡，她却在多年前闹出过一件轰天动地的大事。伏苓原本已有心上人佘鸿儒，奈何要嫁给杜仲为妾，鸿儒在她成亲之日带她出走，却给杜仲亲友撞破，被捉至厅前公审。伏苓不畏浸猪笼承认与鸿儒相爱，扬言比嫁给杜仲为妾更幸福。杜仲被伏苓激发，借意喝骂伏苓，驱逐他们离开家乡，伏苓诧异。
来到存仁馆，伏苓眼见跌打馆变成赌坊，师弟葛根被师兄童铁骨打骂，伏苓赶走赌客，铁骨伸手打她时被葛根一手挡开至脱骹。伏苓跟葛根回家见麻麻戴娣和姑母伏明珠，明珠要伏苓赎回存仁馆，屋契则仍在「那人」手上，伏苓闻言面有难色。她躲在暗角监视杜府，并见杜仲出诊时走入妓院。
末代御医剧照
世凯邀请杜仲出诊
伏苓偷入杜府书房寻找屋契，期间不慎打翻香炉，惊动身处卧房的杜夫人百合，伏苓急忙逃去。百合不慎跌倒，伏苓于心不忍救出百合，方知她不良于行。百合谓自小患过大病，自此双脚不能走动。杜仲回来似乎不认得伏苓。伏苓认为杜仲好色，庆幸没有嫁入杜家。
杜仲本为良济赞堂名医，求诊病人不计其数。一天，两名大汉奉袁世凯之命找他出诊，杜仲到袁府时见到两名面带瘀伤的医师，杜仲为世凯爱妾把脉，认定她并非怀孕而是体内积存血块，开了一剂「滑胎药」服用，世凯不信。
杜仲交还伏苓屋契
世凯爱妾果然药到病除，世凯重赏杜仲却被婉拒，同时对于杜仲不畏威名而留下好印象。伏苓知道存仁馆要改为妓院，唯有再次到访杜家，以替百合做蒸脚为由，再潜入书房偷屋契，岂料被杜仲捉个正着。其实杜仲早已认出伏苓，伏苓坦言要取回存仁馆屋契，事败后失望离去。眼见铁骨拆存仁馆，伏苓跟铁骨理论不得要领，戴娣拿着屋契到来，铁骨无奈交回存仁馆。伏苓质问杜仲有何居心，杜仲向她提出每日上门为百合按摩和蒸脚作为条件，伏苓答应。
末代御医第2集剧情介绍
杜仲为慈喜治怪病
播出日期: 2016.03.29 (二)
世凯使人送来轮椅赠百合，更有意罗致杜仲担任其新军军医，杜仲推辞。杜仲到教堂与泰来神父交流医术，神父请他为一位李姓好友医治咳嗽。杜仲为他把脉后，始道出其病因并对症下药。
存仁馆重新开张，伏苓和葛根戮力推销秘制药丸和药酒，可惜无人问津。同时，债主到来追收铁骨早前购入名贵药材的欠款。伏苓为欠债伤透脑筋，葛根称愿意打擂台赚钱还债，可是葛根在开赛后不足三分钟就被俄国大力士打至重伤。
慈喜手脚无故瘀伤
葛根重伤倒地，伏苓喝停后即喂他服用「还魂丹」药丸，葛根吐出一口瘀血后回复气力，自行走下擂台。伏苓为葛根治伤时再遇债主临门，俄国大力士和擂台主持打算向伏苓购入大批「还魂丹」，债主亦称愿意与伏苓合作赚钱，存仁馆得以暂时解困。杜仲看过曾医治咳嗽患者的名帖后，始得悉李姓友人正是李鸿章，鸿章赞赏杜仲医术，并邀他为一位「贵人」治怪病。
杜仲来到颐和园乐寿堂后似有所悟，如他所料患者正是慈喜太后，并发现她的手脚出现无名瘀伤。杜仲细心检查太后身体以及留意房中摆设，认为慈喜所患的怪病全因邪风入侵所致，要除去怪病，须连续作法七天及服药七日，自然药到病除。
慈喜梦行症发作
杜仲跟任锡庚到值班室，忽闻乌鸦凄厉叫声，才知道牠们在宫中吃饱饲料便会飞走。翌日慈喜质问杜仲她的手脚仍有瘀伤，杜仲指出瘀伤再现乃是体内邪气迫出所致，他为慈喜检查脚部，却发现慈喜脚有伤痕，但袜子却干净如新。他跟随碗佳格格到杂物房找寻慈喜的旧袜子，但见袜子上染有血迹和黏有乌鸦粪便。他们再到颐和园的索伦杆，又发现有不少雀粪和饲料残渣。至半夜时，杜仲在慈喜寝宫外发出乌鸦叫声，不久连英和玉贵伴着只穿睡衣的慈喜外出，慈喜边行边跌跌撞撞，来到索伦杆前，慈喜双手做出挖掘动作，似乎找到东西，慈喜双手捧着返回寝宫，杜仲认定慈喜患梦行症。
杜仲治愈慈喜心病
杜仲已想好法子治慈喜梦行症，这日他陪伴慈喜到花园散步，碗佳和幼兰同在身旁，碗佳发现假山内有一个人形布偶，布偶背后写着慈喜姓氏，看来是对慈喜施了厌胜术，杜仲建议将布偶烧毁，诅咒便化为灰烬，慈喜的脸露宽容，她明白是杜仲治好她的心病。杜仲借机向慈喜道出只有亲情永留心中，慈喜似有所悟。慈喜到瀛台送光绪一瓶补药，岂料光绪竟对慈喜囚禁珍妃表示不理解，惹得慈喜不满，拂袖而去。
######末代御医第3集剧情介绍
杜仲被赐封御医
杜仲从外归来，百合向杜仲追问为哪位贵人治病，杜仲三缄其口。杜仲姑母杜秋萍担心无子嗣，得知百合不反对杜仲纳妾，遂带少女金花到药店给杜仲相亲。杜仲在翻阅医书之际似有发现，竟要秋萍带金花再见他但不许她化妆。百合向伏苓倾诉杜仲纳妾，伏苓替百合不值。
秋萍带金花到酒楼与杜仲相见。伏苓冤家路窄遇着铁骨，为避开铁骨寻仇遂走进酒楼其中一厢房躲藏，却见杜仲、秋萍和金花正坐着，伏苓说代百合而来。伏苓向金花进言，遭杜仲驱赶离去。
光绪观戏珍妃滑胎
杜仲向百合道出再见金花是为其看病，发现她因为过于浓妆艳抹以致皮肤中汞毒。慈禧供奉文殊菩萨，在颐和园搭建戏棚，属意端郡王载漪与子溥儁陪同观戏。隆裕与慧贵妃、瑾妃求光绪出席，光绪为求早日与珍妃相见答允出席。岂料隆裕所选两出剧目掀动光绪反叛之心，决不亲选剧目以令慈禧难堪。
慈禧找溥儁挑选，直到礼佛仪式开始，慈禧要光绪返回瀛台静养，隆裕等人愕然。在北三所小房子里，珍妃求送饭菜的余嬷嬷下次带开胃酸菜，余嬷嬷离开时看到珍妃作呕状，起了疑心。在北三所，珍妃睡不安宁并感到腹中不适，其后更发现满手是血。
杜仲被荐入太医院
慈禧知道珍妃滑胎大为震怒，以为是珍妃与她作对才隐瞒怀孕之事，涴佳推荐杜仲入太医院。杜仲送了多种名贵食材到存仁馆，拜托伏苓以后多加照顾百合。多位御医见杜仲被慈禧赐封为御医，妒忌之余又担心自己地位不保。锡庚介绍太医院运作，怀安交出奇难杂症予杜仲跟进。
荣亲王女儿升平格格，因为对药物敏感而不能服药，杜仲使用蒸气令格格吸入药气，果然药到病除。成亲王福晋诞下小贝勒，其舌头伸出后无法缩回口腔内，杜仲在福晋背后拿起花瓶并用力摔地上，发出砰然巨响，福晋大骂同时小贝勒舌头已缩回口腔内。
杜仲治愈珍妃心病
锡庚带杜仲到珍妃住所却被珍妃追逐棒打，涴佳劝止。涴佳谓珍妃自滑胎后，忆子成疾，精神恍惚。杜仲认为除服用养心安神药，还须医治心病，让她安葬死胎才是解决办法。杜仲和锡庚为珍妃申请死胎，宗人府和太医院互相推卸，杜仲只好以偷窃死胎交予珍妃安葬。慈禧召见各大臣商讨溥儁登基之事，众认为应三思而行，慈禧唯有搁置登基之事。载漪不忿，世凯进言称要赢必先要有实力，载漪闻言似有对策……
末代御医第4集剧情介绍
光绪病入膏肓
播出日期: 2016.03.31 (四)
金花与母买嫁女饼，伏苓以为她要嫁杜仲，金花称杜仲看出她中了汞毒，服过杜仲的药后皮肤变得光滑。伏苓在杜府见到一户家丁送来厚礼，感激杜仲用激将法令他家老爷服药，伏苓有感错怪杜仲。伏苓离开杜府后见杜仲背着药箱到妓院，以为他往嫖妓。伏苓冲入房间并向杜仲拨水为百合出头，如意解释杜仲替她们看病。葛根陪伏苓到庙宇参神，转身时不小心撞到迎面而来的玉贵，使他几乎跌倒，玉贵见到葛根时神情怪异，遂跟踪至存仁馆。
伏苓自由出入宫廷
伏苓见玉贵未能带她入宫谋差事，于是转向杜仲埋手。杜仲鉴于伏苓为人过于冲动，恐受牵连而拒绝，伏苓死心不息，想尽方法务求杜仲介绍她到宫中办事。杜仲见她为家人谋差事，不禁生起测隐之心，终带她见院使大人艾文光。伏苓虽然通过测试，却因太医院从未聘用女医而要她请回。此时，隆裕扭伤颈却不肯由太医院男御医治理，伏苓请缨效劳。
隆裕满意伏苓的推拿手法，伏苓乘机危言耸听，谓隆裕颈痛积劳已久，随时祸及生育，隆裕大惊并给伏苓令牌每日自由进宫为她推拿，伏苓诡计得逞。
伏苓受命寻神秘人
伏苓向七叔报喜取得隆裕信任，可以自由出入宫中。七叔要伏苓追查神秘人下落，那人正是提供皇宫消息予组织，但由于负责与神秘人联络的手足刚去世，组织盼伏苓潜入宫中与他联系。
组织只知神秘人非男人，且小腿近脚争刻有蝠鼠纹身图案。为打探脚争有蝠鼠纹身，伏苓向隆裕提议为她按脚推拿，隆裕应允。众妃嫔知道隆裕因按脚推拿变得年轻貌美，纷纷找伏苓按脚推拿。
杜仲专责医治光绪
载漪探望病榻中的光绪，光绪指他近日腹泻不止。慈喜从载漪口中得知光绪腹泻，载漪乘机指称不可一日无君。连英为慈喜递上披风御寒，披风正是光绪多年前送赠，慈喜暖在心头。
慈喜责成文光叁人，怀安提议杜仲为光绪诊治，慈喜淮许。怀安其实担心光绪命不久矣，若杜仲治不好光绪，他们可以置身事外，若医好则他们推荐有功，故无论如何，他们只会立在不败之地。
光绪自变法失败被慈喜软禁瀛台，更与珍妃天各一方，杜仲对光绪境况寄予同情。光绪却不肯被杜仲诊治，赶他和锡庚离开。
######末代御医第5集剧情介绍
杜仲发现光绪中毒
播出日期: 2016.04.01 (五)
在仍未查明病因前，杜仲建议光绪饮用生理盐水以防缺水和缺盐。他赶到北三所告知珍妃光绪病况，珍妃写信除了表达思念之情，还要光绪相信杜仲，才能早日痊愈。光绪依从服用生理盐水，杜仲还带来珍妃赠送的牡丹花，劝光绪振作。
伏苓从皇后妃嫔口中得知光绪患重病，由杜仲专责医治，她向杜仲打听，杜仲守口如瓶，伏苓只好作罢。伏苓向七叔报告，谓组织未筹够钱推翻清朝，担心错失机会。
葛根初次邂逅德龄
存仁馆来了两位客人阿虎和阿豹购买救伤用品，他们竟是葛根儿时的玩伴。载沣与德龄策马来到熙来攘往的大街上却无法穿过人群，载沣陪德龄步行往教堂，更相约德龄翌日吃午饭。德龄与神父聚旧，又准备弹琴给神父欣赏，刚巧有病人找神父，德龄留下独自弹琴，琴声竟吸引送货的葛根，他躲在一旁静听，二人一见如故。
葛根带德龄到花园参观圣母像，其时见到虎和豹向圣母像淋火油企图烧毁圣母像，德龄阻止。虎看见德龄西化衣着打扮，认定她是假洋人，要捉拿她向义和团领赏钱。葛根阻挡不及反被他们一同捉着。德龄告知兄长会付出赎金，虎、豹闻得丰厚赎金暂且放过二人。
杜仲细查光绪寝宫
翌日虎拿了德龄的字条到酒楼找载沣，载沣以取赎金为由拖延时间，实情跟踪虎返回巢穴。载沣怒喝虎，虎以匕首架着德龄，载沣使计引开虎注意，趁机与葛根上前扑去，载沣成功救回德龄，葛根打晕虎却受了伤。杜仲怀疑光绪中毒，再到瀛台检视光绪寝宫，期间留意到牡丹花枯萎却有檀香味，之后又发现香炉已无灰烬。经查问太监后，杜仲知光绪每晚燃点檀香促使入睡，杜仲觉得檀香可疑，遂找来两只白老鼠做实验。
杜仲证实檀香有毒
伏苓为百合制作糕点并交予杜仲，杜仲取过后促她离去。杜仲静观白老鼠有何变化之际，有一黑影从外而至，时杜仲已留意白老鼠没有叫声，打开木箱见白老鼠明显死去，杜仲相信檀香有毒，而黑衣人乘时取硬物向杜仲打过去，杜仲惨叫一声，黑衣人取去老鼠和檀香夺门逃走，却与伏苓碰着，伏苓见杜仲受伤结果让黑衣人逃去。
杜仲从光绪得知檀香是载漪送赠，要他小心防范。时载漪再赠檀香，光绪虽接受但会暂时停用，载漪知奸计被杜仲识破，气极而去。载漪感谢世凯使他避过一劫，世凯表明会好好封存毒檀香，气煞载漪。
末代御医第6集剧情介绍
杜仲代伏苓顶罪
播出日期: 2016.04.04 (一)
为解开皇帝心结，杜仲愿意为光绪和珍妃传递书信。明珠跟葛根开玩笑，故意在德龄面前不停指示他干粗活，德龄替葛根不值，请载沣为葛根谋份好差事，载沣为讨德龄欢心，聘葛根作他的近身侍卫。伏苓在宫中教众多嬷嬷学习替宫女按脚，其实是检视她们的脚踭有否纹身，结果令她失望，但她知道还有一位余嬷嬷要留在北三所，无法来学习。这日伏苓代锡庚随杜仲为珍妃诊症。
光绪珍妃久别重逢
杜仲替珍妃把完脉，将光绪交托的信函转至珍妃，珍妃看后泪流满脸，伏苓同情，竟大胆应承和杜仲为他们安排见面，珍妃破涕为笑。杜仲虽然责备伏苓任意妄为，但觉得有办法治好他们，他也愿意一试。伏苓教余嬷嬷为珍妃按脚，观察二人亦无纹身。杜仲告诉文光瀛台太监染了怪病，要光绪迁往养心殿。另方面，他带锡庚和伏苓为珍妃诊症时，将珍妃假扮成锡庚带她离开北三所，往养心殿会见光绪。二人久别重逢，互诉衷情，杜仲与伏苓在门外把风。二人闲聊之际，忽闻慈禧到来，他们大吃一惊。
杜仲嘴肿伏苓涂药
慈禧赫然见到身穿官服的珍妃，脸色一沉，杜仲称安排光绪与珍妃会面，只是为医好光绪的相思病，若然失职等同违抗慈禧懿旨，故才有此安排。慈禧借意处罚伏苓，杜仲愿一力承担，慈禧念及杜仲医好她，只命人掌杜仲嘴作惩罚。光绪与珍妃诚心请罪，慈禧准许珍妃待在光绪身边，以一个月为限，看光绪能否康复。
伏苓为杜仲带来消肿药膏，还亲手替他涂抹，她骗百合说杜仲要留在太医院值班未能回家。隆裕得悉珍妃搬往瀛台侍候光绪大感意外，这时太监小林子代光绪送糕点来，并请隆裕和瑾妃往瀛台出席晚宴。晚宴其实是珍妃安排，她想隆裕和瑾妃在慈禧面前为光绪多讲好说话，光绪在宴席中叹息未能为祖宗传宗接代。
慈禧赞成利用拳民
葛根随载沣到颐和园花园，见瑜、慧两位贵妃，以及涴佳和幼兰。载沣送她们香水，逗得各人笑逐颜开，幼兰更是芳心暗喜。杜仲和锡庚一同走到京城大街，见义和团拳民聚集，拳民领袖铁骨还示范饮符水可令人刀枪不入。有年轻人指铁骨妖言惑众，铁骨硬灌他饮下符水，但见年轻人痛苦呻吟，杜仲和锡庚即带他附近的存仁馆救治。伏苓向杜仲解释刀刃不伤人之谜。慈禧与各大臣商讨国事，鸿章指义和团已逼近京城，提议阻止拳民入京，载漪则认为可倚仗拳民的神功护体，挫洋人锐气。此番话正合慈禧心意，决定利用义和团向洋人还以颜色。
######末代御医第7集剧情介绍
伏苓主动替杜仲涂药
播出日期: 2016.04.05 (二)
德龄与载沣约会后，由葛根陪她到教堂，途中遇到义和团拳民，他们乔装混入拳民中同到教堂。伏苓在街上遇到秋萍和杜仲，听到拳民到教堂捣乱，担心神父安全立即赶往。铁骨在教堂大肆搜掠，又强迫孕妇饮符水，被杜仲和伏苓喝止。葛根机警带小孩子躲避脱险，却被铁骨发现遭到拳打脚踢。这时孕妇要生孩子，伏苓愿意以性命交换孕妇，杜仲却抢了匕首自插腹部，这时载沣带兵捉拿拳民，神父即替杜仲做手术幸无大碍。
伏苓换药百合押醋
伏苓不只挨通宵为杜仲制医治刀伤药膏，还为他涂抹，令杜仲感激。杜仲复原返家，他向秋萍承认伏苓是他的逃婚的妾侍，他没告诉百合是不想引起她误会。杜仲要百合帮他换药，这时伏苓又来替杜仲换药，百合已生醋意，伏苓却未有为意。杜仲怀疑拳民饮的符水含五石散，他找出了化解五石散药物，拳民吃了药果然康复，杜仲将药单交予神父，伏苓自愿上山采摘草药。这天杜仲带百合出外游玩，遇见一群拳民到处派传单，其中一年轻拳民被母亲阻止，拳民一手将母亲推跌。
光绪被瞒服壮阳药
杜仲看不过眼，教训该拳民，惹来其他拳民不满，部分拳民将杜仲和百合分开，部分将轮椅不停打转，百合吓至瓜瓜大叫，他们其后更将百合推倒，杜仲不值拳民所为。珍妃很想光绪能强身健体，雨露能均分予皇后和瑾妃，伏苓主动开药方交予珍妃。隆裕找怀安，怀安送她壮阳药散，瑾妃得知隆裕留宿光绪寝宫，狠得咬牙切齿，也找怀安给她送药散。
慈喜喜闻隆裕和瑾妃到瀛台侍寝，甚感安慰。是夜珍妃送茶予光绪，二人嬉戏追逐时，光绪忽晕倒。慈喜得悉光绪发病是服食壮阳药之故，大兴问罪珍妃和伏苓，隆裕和瑾妃却脸露不安，而珍妃则呼冤。杜仲为光绪诊治后向慈喜覆命，说光绪曾饮的大补汤是他开的，非伏苓的祖传秘方。杜仲解释，光绪接连宠幸皇后和瑾妃，才使身体过于虚耗。杜仲自责照顾龙体不周，慈喜观察隆裕和瑾妃，心中有数。
慈喜责光绪勾结外国
杜仲向珍妃道出光绪的脉象显示他曾服壮阳药，伏苓猜想是隆裕曾暗地给光绪服食。珍妃明白因涉及隆裕，慈喜才不把事情闹大。光绪关怀杜仲的伤势，知悉他被义和团拳民所害，而拳民又到处伤害洋人和烧使馆。光绪传召载沣商议向诸国修书释出善意，载沣愿向诸国送信。英美德日四国公使齐向慈喜谴责义和团，慈喜却维护义和团，令公使气愤。慈喜召见光绪和载沣，以为光绪给予公使好处，向她逼宫还他政权。
末代御医第8集剧情介绍
光绪进谏 反对开战
播出日期: 2016.04.06 (三)
光绪向慈喜进谏，认为与西洋诸国接触，只为解决困局，慈喜不接受意见。光绪顶撞慈喜，自觉身分如同傀儡，把慈喜气至晕倒。光绪在乐寿堂外等候消息，知道她无恙才返回瀛台。慈喜认为光绪受珍妃唆摆，有意废掉她，经瑜、慧两位贵妃劝止才作罢。光绪返回瀛台又再病发，杜仲到乐寿堂为慈喜请脉，乘机向她引述有病人患上伦常矛盾心病，自我放弃，慈喜听出杜仲弦外之音，杜仲借机进言，医治病人的心药就在她心中。
伏苓断消息人士线索
伏苓知道怀安卖壮阳药给隆裕和瑾妃，要杜仲向文光告发，杜仲反劝她勿多管闲事。伏苓为扭伤脚的陈吗吗按脚，竟发现她脚争上有蝠鼠纹身，向吗吗唸起暗号，吗吗毫无反应，伏苓猜想吗吗不是消息人士，便向她打探纹身者身分。陈吗吗讲出是位男人，伏苓托吗吗为她引见。在约定时间还未见陈吗吗出现，伏苓四出找寻，却见她伏尸在通道上，这时载漪刚经过捉她回去审讯。杜仲赶来了解，经御医关百川验过尸体认为无可疑，可能是中风失救致死，载漪性性然离去。伏苓知道找错对象，决定向太监打探，另方面她求杜仲再为陈吗吗验尸，被杜仲拒绝。
葛根学西洋舞示爱
伏苓托锡庚找到陈吗吗的病历，确定她身体强壮，甚少病痛。伏苓到停尸间欲找出吗吗的死因，杜仲怕她又惹祸于是出手验尸，却发现吗吗脸上浮现疑似掌印，怀疑她被人用手掌焗至窒息而死。杜仲要向上级报告，被伏苓阻止，其实她是怕揭露消息人士身分。
德龄送葛根西洋礼服，要他参加她的生日舞会，葛根穿上礼服浑身不自在，伏苓教葛根邀德龄跳西洋舞，以舞向德龄示爱。葛根来到德龄的舞会，吃西餐时，幼兰听到载沣指香妃吃花瓣令身体散发幽香，她也偷吃几片。至舞会开始，载沣捷足先登与德龄翩翩起舞，葛根无奈。
慈喜招揽拳民开战
载沣遇见瑜、慧两贵妃，瑜贵妃不经意提载沣玫瑰花盛放，说罢独自到玫瑰园赏花。赏花时突然有人从后拥抱，瑜贵妃早知是载沣，与他缠绵好一会。光绪再穿上朝服出席听政，商讨诸国调兵对付义和团，载漪赞成朝廷向诸国开战还以颜色，光绪反对开战，二人各执己见。慈喜向各大臣征询意见，各人均以慈喜马首是瞻，慈喜决意招揽义和团与载漪的军队合力对付西洋诸国。载漪带世凯参观拳民的神功护体表演，世凯笑而不语，赞赏载漪的士兵骁勇善战。载漪盼世凯相助，世凯不曾表态，只向载漪奉承。离开军营，世凯立即赶返山东，似另有打算……#########末代御医第9集剧情介绍
伏苓主动帮杜仲推拿
播出日期: 2016.04.07 (四)
伏苓向珍妃献计，由她邀隆裕和瑾妃为光绪表演舞艺，可惜瑾妃舞技有限，令隆裕受伤。瑾妃斥责珍妃，更将多年不满情绪向她发泄，珍妃心中受屈。
伏苓从其他吗吗打探到陈吗吗常取得宫中的名贵药材，她不知已有神秘人在旁窥探。杜仲对陈吗吗每次由百川诊治抱疑问，忽想起百川拇指上有一玉斑指，与陈吗吗脸上的瘀痕位置相似，他担心伏苓有意外。伏苓以为百川是消息人士，向他唸暗号，百川不明，却怕她泄密要杀她。
杜仲伏苓互相躲避
伏苓乘时制服百川将他绳之于法。杜仲由于与百川打斗扭伤颈椎，伏苓帮他推拿，二人有讲有笑，令戴娣和明珠误会他们余情未了。伏苓向她们表明与杜仲没有任何关系，却给杜仲听到大为尴尬。伏苓一早到杜家为百合蒸脚，杜仲借故提早离家到太医院，避开伏苓。
敏全担心百川倒卖药材受牵连，怀安嘱他小心行事，他要想办法消除杜仲，避免被他破坏好事。各御医抱怨杜仲处事鲁莽，令太医院蒙羞。杜仲不以为自己有罪，在各人争论得面红耳之际，碗佳奉慈喜口谕要随杜仲学习医术。杜仲给碗佳大堆医书要她熟读，碗佳头痛。
余吗吗疯癫祭婴灵
伏苓借送玉贵名贵礼物，教授宫中各太监推拿为名，实为找寻消息人士，玉贵答应帮忙。锡庚给碗佳背诵医书，怎知发现她在书堆里睡着，伏苓到太医院找杜仲帮忙教太监推拿，杜仲藉词教碗佳医术推辞。幼兰脸上长满红点，杜仲怀疑她吃了致敏食物，幼兰有意隐瞒，杜仲故意离开，却在门外大声指出幼兰病情恶化。原来她误信载沣所讲吃花瓣会散发体香，杜仲知道如何医治幼兰。珍妃念着死去胎儿每夜睡不安宁，伏苓愿代她去拜祭婴灵。伏苓与杜仲前去祭祀，突然看到余吗吗疯疯癫癫来拜祭婴灵，更说不是她害死它，伏苓杜仲感奇怪。
杜仲暂停伏苓推拿
杜仲推测余吗吗与珍妃滑胎有关，是夜他与伏苓再到北三所，由伏苓假扮珍妃向余吗吗追问是谁杀死她的孩儿!余吗吗不肯招出谁是主谋，还吓至晕倒。二人返回太医院，锡庚跑来告知余吗吗悬梁自尽，杜仲检验余吗吗死因没可疑。杜仲警惕伏苓勿将事件张扬开去，要她保守秘密。
百合将伏苓留下的饼送给杜仲吃，杜仲不期然思念伏苓。为免对伏苓生情，杜仲藉词伏苓宫中事忙，向百合暂停推拿，百合赞成。光绪召载漪要他向慈喜阐明义和团的骗人伎俩，向洋人议和才可避免生灵涂炭，载漪却道是奉慈喜之命向洋人开战，光绪警告载漪，并说对他曾作过的行为，他可以既往不咎……
末代御医第10集剧情介绍
杜仲救人 自我牺牲
播出日期: 2016.04.08 (五)
慈喜率众妃到庙中礼佛，光绪与珍妃在庙外跪拜，请慈喜停止向联军宣战，慈喜觉得光绪向西洋诸国屈服，不配为人君。光绪愿退位让贤，以请慈喜收回成命。慈喜以为光绪受珍妃唆摆威胁她，命人掌掴珍妃，光绪哀求至吐血晕倒。怀安向杜仲单打，认为有人多管闲事，引起光绪关注外间事，使他未能安心静养。1900年八国联军攻入北京，载漪和载沣接慈喜离宫西狩，玉贵到瀛台接走光绪，但独留珍妃在北三所，光绪嘱杜仲接珍妃跟上大队。
伏苓留下珍妃躲藏
杜仲带珍妃和伏苓离开紫禁城，遇上英军杀入。杜仲指珍妃和伏苓是宫女，才获英军放行。紫禁城到处被联军掳人放火，杜仲要伏苓带珍妃往小屋躲藏，他则去救其他宫女。葛根返存仁馆保护各人，金赞到杜家接走百合。伏苓和珍妃等了一段时间，尚未见杜仲回来，伏苓决定外出找杜仲，留下珍妃躲藏。伏苓在宫中遇见到一联兵穿朝服的男子，以为是杜仲，奋不顾身拯救，冷不防联兵从后刺杀伏苓，这时杜仲扑出挡了一刀。二人赶返小屋，珍妃已不知所终。德龄到存仁馆找葛根，却被铁骨胁持走入存仁馆躲避洋兵追杀。
杜仲伏苓各怀心事
杜仲邀伏苓到家中暂避，两人闲聊，讲述她当年与鸿儒离开北京到广州，因生活逼人，伏苓也外出打工帮补生计，直至有晚下班回家不见鸿儒，他留书谓不能再吃苦，此后她再没见过他。杜仲赞赏她曾有一段轰轰烈烈的爱情，伏苓却羡慕他与百合无风无浪过日子。半夜，伏苓与杜仲各怀心事，伏苓拿着玉珮嗟叹下半生要孤独终老，无聊下拿起杜仲的医书翻阅，竟找出杜仲写的诗，想起当年离开杜仲的情景，令她增添几分愁绪，时杜仲送厚被给伏苓保暖，伏苓的手无意中触碰杜仲，杜仲也添惆怅。翌日锡庚找杜仲返太医院收起藏书，这时日军大佐领兵进驻，他要御医交出《青囊书》。
杜仲救治日帅枪伤
杜仲向大佐推荐锡庚能默写《青囊书》内容。杜仲要锡庚将他多年行医心得写出来，既瞒天过海，又可拯救太医院各人。伏苓等候杜仲多时尚未见他出现，折返太医院，只见数位太医，独不见杜仲，担心他有意外。待大佐出现时，伏苓向大佐袭击，混乱间枪伤大佐，伏苓被副官擒获。杜仲和锡庚已默写完医书走出房间，看到大佐流血不止，杜仲请缨为大佐做手术，但要保证不可伤害各人。杜仲凭着他曾看过泰来神父做手术，成功取出子弹，大佐手术成功身体无恙。大佐答应放过太医院各人，唯独用枪指着伏苓……#########末代御医第11集剧情介绍
百合揭穿杜仲伏苓关系
播出日期: 2016.04.11 (一)
大佐见杜仲甘愿自我牺牲，有情有义，决定放过伏苓和太医院所有人。杜仲邀伏苓返家躲避联军，二人在家有说有笑，忽然见百合因为担心杜仲安全而返家，杜仲除惊喜外，更因伏苓在家而尴尬。百合见伏苓后面露不满，伏苓也匆匆离开。百合故意向杜仲打探当年逃婚妾侍的去向，杜仲支吾以对。百合在书房发现留下的被铺染有口红印，觉得杜仲有事隐瞒。
百合得悉伏苓身分
瑜贵妃和军机大臣商议政事，商讨联军提出的议和条件，载沣向鸿章冷嘲热讽，令鸿章胃痛发作。朝臣退下，瑜贵妃情不自禁要跟载沣亲暱却被拒绝，要她忍耐直至他登上皇位。秋萍无意中问起伏苓推拿的事，令百合怀疑。及后百合于大街暗角躲藏时，偷听到明珠和何青大谈伏苓与杜仲再生情愫，惊悉伏苓就是当年逃婚的妾侍。
载沣得悉瑜贵妃召见德龄后，匆匆入宫找她算账，瑜贵妃说明她得不到的，别人也休想得到。德龄将翻译文件交予瑜贵妃，瑜贵妃故意要帮德龄做媒，有意令载沣难堪。杜仲到王府请载沣帮忙找珍妃，之后匆匆与伏苓会面，原来一切竟是由百合安排!
伏苓杜仲天意弄人
百合揭穿杜仲和伏苓早已相认，只有她被蒙在鼓里，认定二人一同背叛她。杜仲和伏苓不约而同向百合发毒誓，表示从没有背叛她。伏苓下了决定，与杜仲划清界线。杜仲安顿好百合后，独自到书房看到自己曾写下的诗，发现多了「天意弄人」四个字，知道是伏苓写的，伤痛下便把诗烧毁。
鸿章签下辛丑条约，慈喜和光绪即将从西安返回紫禁城。杜仲有意辞去太医院工作陪伴百合，百合听到感心甜。七叔催促伏苓找出宫中内应，伏苓不想再与杜仲在宫中碰面，有意推辞工作，七叔晓以大义劝她要以革命为重，伏苓无奈继续追查。
玉贵被俘珍妃失踪
杜仲未能寻找珍妃自觉失职，向光绪请辞，光绪反要他留下尽力寻回珍妃。原来在慈喜出走西安时曾经遣玉贵回宫找寻珍妃。载沣从联军俘虏名单中找到玉贵，却无珍妃在内。玉贵向慈喜和光绪禀报，当他返回紫禁城后即被联军囚禁大牢，继而不知珍妃去向。
御医报告太监和吗吗出现屙呕征状，杜仲怀疑水源问题，他与锡庚调查多个水井未有发现，锡庚在其中一个水井发现死尸，杜仲观察死尸已发胀，推测此乃井水受污染的源头，杜仲再仔细观察死者的衣服，觉得似曾相识……
末代御医第12集剧情介绍
杜仲找出害死珍妃真兄播出日期: 2016.04.12 (二)
载沣向慈喜禀报珍妃死于井底之内，大家猜测珍妃怕受洋人凌辱投井自尽，但杜仲不信她投井轻生，慈喜禁止各人向光绪泄露珍妃已死。七叔要伏苓尽快查出内应和有关朝廷潜伏组织里的奸细名册。杜仲落井底找寻珍妃死因线索，发现井底墙壁有抓痕，他推测珍妃曾挣扎过，最终力竭而沉没。他又从载沣的俘虏名单中，发现玉贵被捕的日期正是珍妃失踪两日之后。
玉贵强抢珍妃珠链
葛根找玉贵喝酒，其实是载沣要他向玉贵打探珍妃之事，怎知玉贵不准葛根提及珍妃，只肯透露他要结婚生子，并送他厚礼作为向他借种传宗接代的代价，葛根很想推辞，但怕影响载沣交托的任务，故找伏苓商量。同一时间，如意向杜仲表明她要结婚，对象是玉贵，而他会找人借种生子。杜仲看见玉贵的聘礼后甚为愕然。
伏苓约杜仲见面，彼此看过玉贵送出的名贵礼物，心中有数。玉贵与如意喝过合卺酒后迷迷糊糊地晕倒，醒来时已被五花大绑。经杜仲和伏苓使计查问，玉贵承认返紫禁城的小屋遇见珍妃，被珍妃发现他私藏珍宝，玉贵还要强抢其珍珠链。
伏苓故意放走玉贵
二人纠缠间，珍妃失足跌落井里，玉贵害怕，连忙逃走。玉贵签下押供词，杜仲将他送交载沣处理，玉贵欲逃走却被葛根扯开他的袜子，伏苓发现他的脚上有蝠鼠纹身，登时想起他是宫中的内应。与此同时，有一黑衣人踢开葛根，将玉贵和供词一并带走。三人追至郊外，伏苓故意扭伤脚，放走黑衣人和玉贵。
那神秘人正是七叔，他带玉贵到破庙后说出暗号，玉贵亦能唸出暗语，他要求七叔以银両交换卧底名册，七叔答允并放走他。玉贵向慈喜请罪，骗说他找不到珍妃，却无意中拾到她的珍珠链私藏起来，慈喜免他死罪只罚他到醇亲王府作仆役。杜仲将珍妃信件和珍珠交到光绪手上，杜仲开解光绪，要他替珍妃胎儿复仇。载漪带着儿子逃难，却被载沣截获。
百合双脚微感知觉
载沣将载漪押至慈喜面前审讯，光绪指载漪下毒害他，又害死珍妃胎儿，连累珍妃无辜惨死，更勾结拳匪，引致八国联军入京掠宝兼要全国百姓为他赔款，罪大滔天，决定革除他所有爵位并发配南疆。是夜，光绪在瀛台设祭坛拜祭珍妃。
杜仲为百合蒸脚，百合要为杜仲煮汤丸慰劳，却不慎被热水溅到，百合惊叫觉得大腿有少许痛楚……#########末代御医第13集剧情介绍
百合自断双脚
播出日期: 2016.04.13 (三)
伏苓知道百合双脚有望康复，替她高兴，用心教杜仲学习推拿，由他运用在百合身上。金赞感到欣慰，但他心感内疚，自责当年逼杜仲迎娶百合。杜仲反而感激金赞出钱出力免其父含冤受辱，更指他照顾百合实属应该。他们两岳婿谈话，被百合听到，误会杜仲积极医好她是想解除束缚。七叔约玉贵收买名单，怎知玉贵只交出一半，七叔只能强忍。杜仲向百合解释，为她推拿是希望带她一起游山玩水，百合积极尝试站起来，可惜力不从心。
慈喜赐婚载沣幼兰
载沣向慈喜痛陈与诸国公使关系的利害，游说她在宫中设宴款待诸国公使夫人，既可改善与西方关系，又可拉拢诸国对抗乱党，慈喜亦觉言之有理，但自己不谙外语无法联谊，载沣建议由德龄统筹宴会。公使夫人感谢慈喜款待，二人交谈时，全程由德龄翻译，但谈话过程当中，英国公使夫人不经意得罪慈喜，令她大为震怒，幸好德龄机灵应变，化险为夷，令慈喜赞赏。当慈喜与隆裕等人一言一语称赞载沣和德龄时，瑜贵妃认为是时候为载沣娶福晋，直指幼兰是合适人选，慈喜也觉得幼兰颇合心意，决定为他们赐婚。德龄惊闻噩耗，载沣怒气冲冲往颐和园去。
百合误会杜仲伏苓
载沣与瑜贵妃狭路相逢，她承认故意拆散他和德龄，是不能忍受自己被抛诸脑后，所以要破坏二人好事，载沣表示不会对她始乱终弃，葛根听到他们谈话，替德龄不值。他到教堂看见德龄痛苦地弹琴，很想告知她真相，但载沣已及时到来向德龄说尽花言巧语。
杜仲每日到存仁馆跟伏苓学习推拿，甚至为求用力精准遂以伏苓作示范，明珠等人不知情，以为他们感情迈进一步，还向秋萍报喜讯。秋萍向百合赞赏伏苓有情有义教杜仲推拿，百合却以为杜仲赶紧医好她，是想早日丢下她这个包袱。
百合断脚伏苓不安
伏苓研制好药膏特来送给杜仲医治百合，杜仲感激。杜仲满心欢喜回家中，看到百合倒卧在前院，轮椅也翻侧。杜仲为百合检查发现她脚骨折断，百合提议找伏苓医治，经伏苓敷药包扎，百合知道双脚无复原机会，倒在杜仲怀中痛哭害怕失去他，杜仲安慰。伏苓感觉百合的话似有弦外之音，令她不安。
末代御医第14集剧情介绍
杜仲救伏苓百合误会
播出日期: 2016.04.14 (四)
百合日渐康复，杜仲再返瀛台，见到光绪练习拳术强身健体，精神颇佳。光绪已策划另一套新政，却又怕被慈喜推倒，杜仲提议可借他人之手执行，光绪觉得此法可行。光绪找载沣议政，载沣认为当日推行新政，是用人不当之故，且操之过急触怒慈喜，光绪向载沣道出新构思，载沣认为可行。载沣特意安排慈喜、光绪和皇后及众妃到花园赏花，当大家吃茶点之际，远处突然飞出大量蝴蝶，蔚为奇观，慈喜欣喜。载沣乘时向慈喜提出推行新政。
载沣追杀伏苓中弹
慈喜虽然觉得载沣新政与当年光绪推行的大同小异，但经载沣以巧言修饰后却讨得慈喜欢心，准他推行新政。载沣的侍卫逮着玉贵，从他身上搜到大叠银票和珍宝，交予载沣处置。玉贵为求脱身，向他供出乱党情报。
玉贵约七叔交另一半名单，七叔接过名单时载沣带着侍卫赶至，时屋顶有多块木板跌下阻挡载沣，一名黑衣人趁机将七叔带走，载沣开枪射杀他们。七叔临终前要伏苓完成革命大业。载沣带侍卫追至石屋附近，葛根入屋发现伏苓中弹晕倒。他赶忙找杜仲救伏苓。伏苓取出子弹后仍然发高烧，杜仲不敢离开。他本来约好回家与百合包饺子，却因救人彻夜未归，令百合大发脾气。
载沣发觉伏苓可疑
伏苓知道杜仲为她取出子弹并照顾她整晚，大为感动。伏苓发现挂在其身上母亲留给她的玉珮不见了，原来杜仲做手术时替她收起。杜仲归还玉珮时却发觉伏苓还未完全退热，便决定返家取药，吩咐伏苓留在石屋等他回来。
杜仲在家中取过药准备离开，始发觉百合在厅中等他，杜仲内疚要推她入房休息。百合坚持和他继续包饺子，但杜仲心里记挂伏苓，心不在焉，最后按捺不住放下百合赶着送药去。
杜仲回到石屋，只见伏苓留下字条，他一脸落寞离开，躲在屋后的伏苓暗自伤心。载沣来到存仁馆追查七叔和伏苓，伏苓适时现身招待载沣。载沣在离开前，发现伏苓与救走七叔的黑衣人身形相似，硬要伏苓替他推拿试探。
百合离家杜仲赔罪
伏苓明知载沣以推拿为名，试探为实，她全力以赴，务求令载沣释怀。载沣再以拳脚功夫试探，伏苓强忍背痛，与载沣对招。
杜仲回到家中，发现百合离家出走。杜仲到洪家向百合赔罪，百合向他大发脾气，她觉得杜仲心中只有伏苓，更忍不住向杜仲道出双脚是她自断，目的是想杜仲永远留在其身边，杜仲闻言不敢相信。
######末代御医第15集剧情介绍
伏苓协助杜仲查案
播出日期: 2016.04.15 (五)
载沣宴请慈喜和两位贵妃品尝由德龄烹调的牛扒，他本想向慈喜说出喜欢德龄的心意，却被瑜贵妃抢先一步要他赶快迎娶幼兰，载沣无奈把话收回。世凯特意送来贺礼，他向载沣分析娶了荣禄女儿，能令他事业更上一层楼，载沣被世凯一言惊醒。载沣深知世凯为人，他想留守京师以及取代鸿章职位，盼载沣向慈喜引荐。载沣与瑜贵妃约会，被德龄发现载沣亲吻瑜贵妃。当载沣打算将德龄金屋藏娇时，德龄却揭穿其恶行。
杜仲查出问题药丸
葛根向德龄示爱，德龄明白葛根对她的爱意，但她只视其为知己，祝福他日后能遇上值得去爱的人，然后黯然离去。葛根明知载沣非善类，他向伏苓表明愿意留在载沣身边，替她打探情报。
慈喜忽然上吐下泻找杜仲请脉，杜仲检查慈喜的消渴症药物没有相冲征状，最后怀疑药材出问题，找来碗佳和锡庚一起试药，却只有碗佳出现上吐下泻症状，而碗佳也只吃过由慈喜赏赐的白凤丸。杜仲检查白凤丸，发现只有部分味道已变坏。锡庚查出白凤丸竟是来自良济赞堂。此时顺天府缉拿金赞归案，并将良济赞堂查封。杜仲返太医院了解，得知是怀安向太医院上报。
杜仲查案岳父身故
杜仲往顺天府监牢探望金赞，见他被打至重伤，金赞向杜仲重申没有卖过期药，杜仲决要为岳父翻案。他转向载沣求助，但案件已交顺天府审理，载沣也不便插手，他提醒杜仲尽快找出证据。杜仲求文光出面向顺天府发还白凤丸检验，怀安认为杜仲只想救其岳父而不理太医院存亡，文光怕连累太医院而拒绝。杜仲返家，却见百合和婢仆伤心拭泪，百合告知金赞死在狱中且已签押认罪，杜仲明白是衙门严刑拷打结案，百合苛责杜仲查白凤丸累事。
伏苓帮忙追查案件
杜仲向碗佳查问宫中的白凤丸，杜仲认为顺天府存放有问题白凤丸，他打算求载沣重审案件，此时有神秘人偷听他们讨论。载沣告知顺天府已销毁证物，杜仲失落。顺天府衙差到杜家缉拿杜仲审问，杜仲进家门前已被伏苓截住带他到石屋躲避，并表示愿意帮杜仲。
伏苓潜入慈喜寝宫搜查白凤丸，怎知连英折返将其逮着，慈喜知她是帮杜仲查白凤丸案，误会她对杜仲仍存有感情，伏苓向慈喜解释不想杜仲含冤受屈，步其岳丈后尘。慈喜觉得伏苓有情有义，姑且原谅她，还要连英交出私藏的白凤丸。杜仲将白凤丸胶囊切开，伏苓发现包裹药丸的蜂蜡有可疑。
末代御医第16集剧情介绍
伏苓劫走 载沣军火
播出日期: 2016.04.18 (一)
伏苓和葛根到蜡厂追查金赞购买的蜂蜡，查出御医殷福致曾买下一批下价货。杜仲发现有人贪财，将旧药丸用下价蜂蜡重新包装，当作新药卖给太医院赚取利润，期间因为包装过程出错令药丸变坏。锡庚要胁福致要分一杯羹，约定在庙中交钱。福致带怀安来杀锡庚，杜仲将怀安、福致绳之于法。良济赞堂解封重开，由百合打理。光绪有感太医院腐败，需进行改革。
载沣强夺世凯军火
百合得悉杜仲破案是伏苓暗中帮忙，又认为杜仲留在太医院，实为留于宫中与伏苓相见，因而对伏苓更恨之入骨。载沣和幼兰完婚，慈喜促他们为皇族开枝散叶。太医院重建落成，由光绪主持搬迁仪式，光绪建议引入西洋医学，并交由杜仲全权执行，各御医对西医有保留，只有锡庚替杜仲高兴。世凯向载沣追问添购的军火何故会落在他手中，载沣称取去军火是为加强保卫京师，令世凯气上心头。
伏苓离京杜仲惆怅
伏苓遇见玉贵与乞丐纠缠，她追赶时被失明的老乞丐阻挠，待她追至山神庙，突然被人从后偷袭，赫见偷袭者正是刚才的老乞丐。武功高强的老乞丐把伏苓制服，又逼她供出组织名单，伏苓视死如归。老乞丐向伏苓掷出三把飞刀，最后一把刀竟把绑着伏苓的麻绳割断。原来此人就是组织的负责人徐扁，徐扁收到线报，得知载沣得了一批军火，组织要伏苓协助劫走。
伏苓在颐和园遇见杜仲，告知翌日离开京师南下广州，杜仲看着伏苓的背影感到惆怅。杜仲到王府为幼兰胎儿把脉，听见玉贵向载沣报告革命党要劫他的军火。杜仲担心伏苓，立即坐车赶去仓库，至山腰时看到仓库爆炸。
伏苓失踪下落不明
仓库共捡出八具被炸至面目全非的死尸，推测是革命党抢军火引致爆炸，伏苓却生死未卜。杜仲晚上再到仓库寻找线索，最终被他找到伏苓的玉珮。杜仲和百合过着平静安稳的生活，百合明白不能留住杜仲的心，但愿留住他的人，其他事一概不重要。杜仲为已有八个月身孕的幼兰把脉，载沣只关心胎儿健康。慈喜与各妃嫔吃过茶点后，嘱咐幼兰到庙里祈福。隆裕、瑾妃和瑜贵妃眼见幼兰受慈喜关爱，心中妒忌。拜毕菩萨，幼兰一时失足竟在石阶上跌倒……#########末代御医第17集剧情介绍
伏苓无恙归来
播出日期: 2016.04.19 (二)
杜仲为幼兰把脉，认为有难产危险，决定请泰来神父为她剖腹产子。载沣回来知悉幼兰要开刀生子，大为震惊，此时已传出婴孩哭声，得知幼兰已诞下小阿哥。载沣责备杜仲找外籍神父接生，更不准他向外透露。
三年后，溥仪长得趣致可爱，瑜贵妃建议留溥仪在宫中陪伴慈禧，载沣赞成。光绪向杜仲透露有意推行君主立宪制，可惜载沣已非真心助他改革朝政。杜仲认为他可向慈禧言明一切，但光绪心中惧怕慈禧。
光绪吸食大麻壮胆
百合将药店打理妥当，已不再介怀自己能否站起来，更坦言只要杜仲留在身边便心满意足。杜仲与泰来神父教年轻医师学习人体器官位置，当泰来解剖尸体时，涴佳和年轻医师看得胆颤心惊。涴佳意外见到葛根在弹琴，便鼓励葛根到外面见识。
杜仲发现光绪吸食大麻，于是立即劝止。光绪解释他知道慈禧约见各国公使，遂吸食大麻只为壮胆，好让他在殿上提出君主立宪。杜仲担心光绪成瘾，损害健康。光绪到了大殿，主动提出推行君主立宪方案，滔滔不绝，竟得公使支持，慈禧却面露不悦之色。
伏苓现身杜仲激动
杜仲给光绪吃多剂泻药，志在清除大麻毒性。慈禧在载沣陪同下到了瀛台，她责备光绪擅自离开瀛台和服食大麻，光绪激动，身体突然抽搐晕倒。慈禧被光绪气至心力交瘁，有意废除光绪。载沣一方面暗里高兴，一方面反劝慈禧假意依光绪意思而行，实则施以缓兵之计，慈禧心动。葛根遇见杜仲，请他为戴娣把脉。杜仲轻描淡写地问伏苓近况，见到葛根神情闪缩，料他有事隐瞒。杜仲躲在街上暗角，果见伏苓离家。杜仲上前跟她相认，更激动地剖白多年思念之情，并交还在仓库拾获的玉佩。
伏苓离开杜仲遇袭
伏苓意想不到玉佩竟被杜仲拾得，拿着玉佩泣不成声，杜仲上前安慰。载沣向光绪汇报已派多位大臣出使西方，考察宪法大纲，光绪询问群臣意见，世凯提议增设军备和愿意出使日本，却被光绪一一推倒。世凯向载沣表明留在军机处犹如投闲置散，意兴阑珊，决意解甲归田，载沣乐意成全。伏苓已安排返回广州，约杜仲游山玩水，二人游玩后到市集闲逛，不约而同看中一款同心结。杜仲细意欣赏同心结时给百合看到，杜仲转赠给她。杜仲返太医院途中突然遇袭……
末代御医第18集剧情介绍
伏苓亲手杀杜仲
播出日期: 2016.04.20 (三)
组织要刺杀光绪，伏苓怕杜仲受牵连遂将他打晕，不让他返瀛台接近光绪。杜仲知道光绪将被刺杀，坚决入宫救他，伏苓思量后决定跟杜仲一起营救光绪。来到光绪寝宫外，伏苓即取出匕首冲入寝宫刺杀光绪，寝宫内原来空无一人。原来杜仲早对伏苓起了疑心，遂趁光绪在养心殿议政时，将计就计带伏苓到瀛台，果然揭穿伏苓要杀光绪。
百合服毒昏迷不醒
百合相约伏苓见面，坦言伏苓回来后扰乱夫妻平静生活。伏苓表明不会破坏她和杜仲，百合仍坚称不会原谅她。她请伏苓饮酒，从此二人恩断义绝。当伏苓与百合取起酒杯时，杜仲赶至并指伏苓的酒有毒，百合闻言伤心，认为杜仲不信任她，接着便将毒酒一饮而尽。
百合经杜仲引吐后已无生命危险，杜仲请假陪伴昏迷不醒的百合。慈禧患消渴症后身体日渐衰弱，慈禧也自觉油尽灯枯，溥仪乖巧地安慰慈禧，岂料慈禧竟说让他做个好皇帝，各人听见后各怀鬼胎。
伏苓亲手杀害杜仲
世凯巴结载沣，又提醒他倘若慈禧比光绪早逝，光绪将重掌政权。载沣早料有此一着，坦言会让慈禧早走一步。他反而提醒世凯当日令慈禧软禁光绪于瀛台，光绪重掌政权后必然对他报仇，世凯面露不悦。
虚弱的光绪再染风寒，身体状况更差，却不舍得放弃君主立宪之事。杜仲对着昏迷的百合，不断诉说从前的开心事，杜仲自责伤透妻子的心，希望百合勿丢下他让他一生内疚。徐扁冒认伏苓相约杜仲见面，企图趁机杀他。伏苓及时来到救走杜仲，徐扁连伏苓也不放过，伏苓逼于无奈求徐扁让她杀杜仲，继而将匕首刺入杜仲腹中，杜仲昏厥……
杜仲查案被追杀
光绪病情急转直下，杜仲赶往瀛台，鼓励光绪勿放弃。杜仲开了重药，可惜未及给光绪服食便已收到驾崩消息。慈禧命杜仲彻查光绪死因，杜仲赶返瀛台遇见世凯，世凯劝杜仲与他合作，杜仲称要彻查光绪死因，为他讨回公道。杜仲返回光绪寝宫，见已清理得乾乾净净，却拾获属于伏苓的玉佩。杜仲怀疑伏苓害死光绪，赶往存仁馆，途中忽然遇到黑衣人追杀，给伏苓救走。伏苓推测黑衣人杀杜仲是要阻止他调查光绪的死因。
######末代御医第19集剧情介绍
伏苓否认杀害光绪
播出日期: 2016.04.21 (四)
杜仲肯定光绪死于砒霜，各人提出杀光绪的可疑人，当中载沣曾被光绪揭穿对君主立宪阳奉阴违，而玉贵则是推珍妃下井的真兄。玉贵所作所为令光绪怒不可遏，到颐和园对他拳打脚踢，弄致头破血流，幸得慈喜制止。光绪更认为是慈喜命玉贵杀害珍妃，激动之下吐血晕倒。载沣除了故意供出玉贵杀害珍妃外，更曾在光绪病后与小林子一同带药给光绪服食。杜仲觉得玉贵和载沣均有可疑，决兵分两路调查。
载沣连英藏有砒霜
隆裕、瑾妃在御花园陪伴溥仪玩耍，瑜贵妃带来糕点讨好溥仪，瑜贵妃得意地向皇后和瑾妃炫耀她与载沣感情深厚，并于溥仪登基后扶助他两父子。载沣听到瑜贵妃这番说话后甚为不满，约见瑜贵妃表明与她划清界线，话未说完便给她掌掴，二人恩情烟消云散。
碗佳等人质问玉贵毒害光绪一事，玉贵断言否认，但他透露曾偷听到慈喜吩咐连英下毒，怀疑是连英所为。碗佳转变追查目标，果然见连英鬼祟地将砒霜埋入泥土。杜仲与伏苓追查载沣，房外的幼兰听到光绪被毒杀，心中惶恐，因为她曾发现载沣藏有老鼠药，她更在房中找到一小布袋，袋中确有毒药。
载沣世凯涉嫌杀光绪
载沣向幼兰承认袋中确是砒霜，为免瓜田李下，才将砒霜收起，幼兰明白事态严重，答应绝口不提。连英被葛根打晕后送到光绪寝宫里，醒来时见光绪身影闪过，并扬言要连英填命，连英吓得连忙解释砒霜是用来毒杀慈喜爱犬，他反指光绪身边两个太监嫌疑最大，其中小林子好赌成性，可能被收买杀害光绪。
小蔡子谓小林子失踪前突然还清欠债，银票是来自世凯。杜仲追问世凯，他只坦言小林子曾向他借钱。世凯到树林找出小林子尸体，正想搜身时，杜仲追踪而至，世凯性性然离开。杜仲检查尸体时，伏苓发现小林子手中握着鼻烟壶，葛根认出是载沣的物件。
光绪死在伏苓怀中
载沣否认杀死小林子，但直认曾收买小林子提供光绪消息，认为是世凯刻意诬陷。碗佳发现幼兰手指溃烂，杜仲怀疑幼兰手指中砒霜毒，伏苓欲调查幼兰，杜仲反质问她为何插赃嫁娲载沣。原来他第一眼见小林子尸体时，其手上并无鼻烟壶，直至世凯离开后，小林子才手握鼻烟壶。杜仲直指伏苓有意离间载沣和世凯，更掩饰杀害光绪的真兄。伏苓否认，指她潜入寝宫时光绪已毒发倒在地上，还误会她是珍妃，在她怀中死去。她将光绪安放床上便离去，却想不到慈喜命杜仲追查光绪死因……
末代御医第20集剧情介绍(大结局)
杜仲找出光绪死因
播出日期: 2016.04.22 (五)
杜仲用银针为光绪验尸，证实光绪死于砒霜中毒，同时发现光绪左手手指溃烂，认定他曾接触过砒霜，而其右手却沾有墨迹。杜仲回想起他返回瀛台了解光绪驾崩之事，除发现光绪口中有异味，书枱上还有毛笔和墨砚，而且墨汁仍未干涸，故肯定光绪死前曾写下遗书。载沣提醒杜仲只有一天时间查出死因，否则人头不保，伏苓知道后心感不安。杜仲返回寝宫，猜想光绪死前一刻曾做过的事。
伏苓交出光绪遗书
慈喜向外公布光绪因病驾崩，伏苓劝杜仲勿介怀他的死因。杜仲不认同，并要为光绪伸冤。伏苓走到密室撬开一块砖头，取出光绪的遗书，原来当日伏苓安置好光绪遗体后发现遗书，便将它收藏起来。她一方面想将遗书交给杜仲以救他一命，同时又怕此举出卖组织，内心矛盾。
杜仲如实告知慈喜光绪是服毒自尽，又感慨皇帝是被身边的人活活逼死。慈喜不相信更反斥责光绪，杜仲从衣袖里取出光绪遗书。原来杜仲入宫面见慈喜时伏苓把遗书交给他，伏苓希望慈喜对杜仲网开一面。慈喜读毕遗书后，伤心欲绝。
杜仲伏苓各奔前程
伏苓安排葛根接莲子和百合到渡头，又催促杜仲离开紫禁城，因为杜仲知道朝廷太多秘密，载沣绝不会放过他。杜仲离开前仍关心伏苓，伏苓却要留下继续革命事业，杜仲依依不舍离开。慈喜亦于光绪宣布驾崩后翌日归天，溥仪登基，载沣得偿所愿成为摄政王。
清朝积弱，载沣无力挽救，他原打算与世凯联手对付革命党，但世凯见将有机会成为大总统，早已不放载沣在眼内，明言只要溥仪退位，他们仍可继续居于紫禁城。宣统三年，清朝终划上句号。直至一九一五年，世凯称帝，锡庚成为京城坊间医师，以仁心仁术医治平民百姓，他内心却仍挂念杜仲。
杜仲伏苓乱世相遇
在南方城镇一处医疗站，杜仲忙碌救治伤兵，分身不暇。此时伏苓扶着葛根到医疗站治伤，但见护士忙于照顾病人，伏苓便自行找药为葛根治伤，时穿着护士袍的碗佳经过，更与葛根相认，伏苓和杜仲也在同一时间相遇。四人聚旧，伏苓和葛根仍为革命奔波，碗佳则跟杜仲参与医疗工作。伏苓从葛根手上得到杜仲地址，来到门前见杜仲为小女孩敷药，以为小女孩正是杜仲女儿，后来才知误会一场。百合亦于半年前苏醒，除了记得自己是杜仲妻子外，其他事情一概忘记得一干二净……